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AI預測最易傳播新冠病毒的動物

[所屬分類:行業動態] [發布時間:2021-11-24] [發布人:網站管理員2] [閱讀次數:] [返回]
AI預測最易傳播新冠(guan)病毒的動物
水貂、穿山甲(jia)和蝙蝠名列(lie)前茅
作者(zhe):劉霞 來源:科(ke)技日(ri)報 
山(shan)東拓普(pu)生(sheng)物工(gong)程有(you)限公(gong)司(si)  //ljxinglong.com
科技(ji)日(ri)(ri)報北京11月22日(ri)(ri)電(dian) (記者劉霞)美國紐約卡里生態系統研究(jiu)所科學(xue)家近日(ri)(ri)開發(fa)出(chu)一款(kuan)人工智能(neng)工具,對5400種哺乳動物進(jin)行了(le)分(fen)析,以預測哪些(xie)最有可能(neng)傳播新冠(guan)病毒。該模型預測表明,水貂、穿山甲和蝙蝠(fu)位列前10%,與實驗室(shi)提供的結果相符。
研究人(ren)員解(jie)(jie)釋稱,新冠病毒(du)通過使(shi)宿主細(xi)胞上的(de)ACE2蛋(dan)白與其刺突蛋(dan)白結(jie)合(he)而感染(ran)人(ren)類(lei)和(he)動(dong)物。但不(bu)同物種的(de)ACE2蛋(dan)白不(bu)同,因此(ci)了(le)解(jie)(jie)其ACE2蛋(dan)白與冠狀病毒(du)刺突蛋(dan)白的(de)結(jie)合(he)程度有(you)(you)助于(yu)預(yu)測哪(na)些動(dong)物最有(you)(you)可能(neng)感染(ran)和(he)傳播(bo)新冠病毒(du)。不(bu)過,科學家目前僅了(le)解(jie)(jie)約300多(duo)種物種ACE2的(de)氨基酸序(xu)列。
為解(jie)決這(zhe)個問題(ti),最新研究開發(fa)了一個機器學習工具(ju),以(yi)預測5400種哺乳動物的ACE2蛋(dan)白能否與原始(shi)冠狀(zhuang)病毒及(ji)其(qi)變異毒株(zhu)的刺突蛋(dan)白緊密(mi)結合,從而傳播病毒——即使不知道它們ACE2的氨基酸序列。
研究小組(zu)首先(xian)估計了已知ACE2序(xu)列(lie)的(de)(de)(de)142種(zhong)(zhong)哺乳動物的(de)(de)(de)ACE2蛋白(bai)與刺突蛋白(bai)結合的(de)(de)(de)強(qiang)度,以及(ji)這(zhe)些物種(zhong)(zhong)是否可(ke)能傳播(bo)冠狀病毒。隨后(hou),他們向人工智能工具提供了這(zhe)142種(zhong)(zhong)物種(zhong)(zhong)的(de)(de)(de)遺(yi)(yi)傳率及(ji)60個與該(gai)物種(zhong)(zhong)的(de)(de)(de)生(sheng)態和(he)(he)生(sheng)物特(te)(te)征(zheng)有關(guan)的(de)(de)(de)信息,以便其能識別(bie)遺(yi)(yi)傳率和(he)(he)各種(zhong)(zhong)特(te)(te)征(zheng)之間的(de)(de)(de)聯系。這(zhe)些特(te)(te)征(zheng)包(bao)括(kuo)物種(zhong)(zhong)棲息地(di)與人類生(sheng)活(huo)區域的(de)(de)(de)重疊程(cheng)度、物種(zhong)(zhong)預期壽命、飲食情況和(he)(he)體重。
結果顯示(shi),該(gai)模(mo)型可(ke)預測5400種(zhong)哺乳(ru)動物傳(chuan)播新(xin)(xin)冠病(bing)(bing)毒的(de)可(ke)能(neng)性。其中,白尾鹿(最近發現它們(men)在(zai)北美感(gan)染新(xin)(xin)冠病(bing)(bing)毒幾率非常高)、條紋臭鼬、包(bao)括某些(xie)鼠和鹿在(zai)內的(de)76種(zhong)嚙(nie)齒(chi)動物,以(yi)及一(yi)些(xie)養殖(zhi)物種(zhong)(如水牛(niu))等,都有(you)可(ke)能(neng)傳(chuan)播新(xin)(xin)冠病(bing)(bing)毒。研究(jiu)人(ren)員表(biao)示(shi),這一(yi)方法(fa)可(ke)確(que)定哪(na)些(xie)動物最應(ying)該(gai)重點監測,這種(zhong)監測將(jiang)有(you)助于追蹤物種(zhong)感(gan)染病(bing)(bing)毒的(de)情(qing)況以(yi)及可(ke)能(neng)會出現哪(na)些(xie)適應(ying)動物的(de)新(xin)(xin)冠病(bing)(bing)毒變種(zhong)。
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